在知网查重中，注释通常不算入总字数。然而，不同学术期刊和学府对此有不同规定，建议在投稿前查阅相关要求。一般来说，注释可以帮助读者理解文中内容，但并不属于正文部分，因此在查重时通常不计入字数。为避免误解，建议在写作时将注释与正文明确区分。

在学术写作中，注释的作用是辅助读者理解文中内容，通常不被视为正文的一部分。因此，在知网查重时，一般情况下注释不会计入总字数。但考虑到不同期刊和学术机构的规定可能有所差异，建议在投稿前查阅相关要求，以确保符合要求。在写作过程中，要清晰地区分正文和注释，以免造成不必要的误解。